A estrutura orgânica do CEAF está prevista na Resolução PGJ nº 59/2011 da seguinte forma:

• Diretoria do CEAF;

• Coordenadoria Pedagógica (COPED);

• Superintendência de Formação e Aperfeiçoamento (SFA);

• Diretoria de Estágios e Convênios Acadêmicos (DECA);

• Diretoria de Formação, Aperfeiçoamento e Pós-Graduação (DFAP);

• Diretoria de Informação e Conhecimento (DINC);

• Diretoria de Produção Editorial (DIPE).

Integram a área de competência do CEAF, por vinculação, três unidades colegiadas, a saber:

• Conselho Científico e Acadêmico;

• Conselho Curador do Memorial do Ministério Público;

• Conselho Editorial.

Integram a área de competência da Diretoria de Informação e Conhecimento (DINC):

• o Arquivo Histórico do Ministério Público;

• a Biblioteca do Ministério Público;

• a Biblioteca Virtual do Ministério Público;

• o Memorial do Ministério Público.

• 7.2.1. Diretoria do CEAF

• 7.2.2. Coordenadoria Pedagógica

• 7.2.3. Superintendência de Formação e Aperfeiçoamento

• 7.2.4. Conselho Científico e Acadêmico

• 7.2.5. Conselho Curador do Memorial do Ministério Público

• 7.2.6. Conselho Editorial