A Coordenadoria Pedagógica tem como finalidade prestar apoio pedagógico ao CEAF, competindo-lhe assessorar o Conselho Científico e Acadêmico na seleção do corpo docente, propor ações para a definição de conteúdos e atividades curriculares, entre outras atividades correlatas.

O Coordenador Pedagógico será designado por ato do Procurador-Geral de Justiça dentre membros da instituição com reconhecida qualificação acadêmica.