A estrutura orgânica do CEAF está prevista na Resolução PGJ nº 59/2011 da seguinte forma:

• Diretoria do CEAF
  
• Coordenadoria Pedagógica (COPED)
  
• Superintendência de Formação e Aperfeiçoamento (SFA)
  
  • Diretoria de Estágios e Convênios Acadêmicos (DECA)
    
  • Diretoria de Formação, Aperfeiçoamento e Pós-Graduação (DFAP)
    
  • Diretoria de Informação e Conhecimento (DINC)
    
  • Diretoria de Produção Editorial (DIPE).

Integram a área de competência do CEAF, por vinculação, três unidades colegiadas, a saber:

• Conselho Científico e Acadêmico
  
• Conselho Curador do Memorial do Ministério Público
  
• Conselho Editorial.

Integram a área de competência da Diretoria de Informação e Conhecimento (DINC):

• o Arquivo Histórico do Ministério Público
  
• a Biblioteca do Ministério Público
  
• a Biblioteca Virtual do Ministério Público
  
• o Memorial do Ministério Público.

{INSERIR IMAGEM ORGANOGRAMA CEAF}

• 7.3.1 Diretoria do CEAF

• 7.3.2 Coordenadoria pedagógica

• 7.3.3 Superintendência de Formação e Aperfeiçoamento

• 7.3.4 Conselho Científico e Acadêmico

• 7.3.5 Conselho Curador do Memorial do Ministério Público

• 7.3.6 Conselho Editorial